Arrêt pour maladie non professionnelle et longue maladie : l’indemnisation

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Congé maladie de courte ou de longue durée : la prise en charge financière

  • Perception d’indemnités journalières (IJ) sous conditions
  • Délai de carence de trois jours (salariés du privé) ou un jour (fonctionnaires)

Vous êtes en arrêt maladie, sans caractère professionnel. Votre congé peut être de courte durée, de quelques jours ou semaines, ou se prolonger en cas de longue maladie. En fonction de votre situation personnelle et professionnelle, les modalités de prise en charge et les compensations financières diffèrent.

Vous devez prévenir sous 24 heures votre employeur et faire une déclaration auprès de votre caisse d’assurance maladie dans les 48 heures qui suivent.

Le régime général de la Sécurité sociale

En compensation de la perte de salaire durant votre congé maladie, vous pouvez bénéficier d’indemnités journalières, versées par votre caisse primaire d’Assurance maladie. Les conditions pour en bénéficier sont strictes et dépendent de la durée de l’arrêt maladie.

Pour les arrêts maladie inférieurs ou égaux à 6 mois : avoir travaillé au moins 150 heures au cours du trimestre qui précède l’arrêt, ou avoir perçu un salaire au moins égal à 1 015 fois le montant du Smic horaire (soit 10 028,20 € bruts en 2018) au cours des 6 mois civils qui précèdent l’arrêt ;

Pour les arrêts maladie de plus de 6 mois (considérés comme des arrêts longue maladie) : avoir travaillé au moins 600 heures, ou avoir perçu un salaire au moins égal à 2 030 fois le Smic horaire (soit 20 056,40 € bruts en 2018), au cours de l’année qui précède l’arrêt, et justifier d’au moins d’un an d’ancienneté d’affiliation à la Sécurité sociale.

En tant que salarié, vous pouvez percevoir des indemnités journalières (IJ) égales à 50 % de votre salaire moyen calculé sur les 3 mois précédant l’arrêt. Si vous avez au moins trois enfants à charge, vos indemnités journalières sont majorées à partir du 31ème jour d’arrêt : elles sont égales aux 2/3 (soit 66,66 %) de votre salaire moyen.

Pour les salariés soumis au régime général de la Sécurité sociale, le versement d’indemnités journalières est plafonné à 360 jours par période de 3 ans consécutifs. Ce plafonnement s’applique quel que soit le nombre d’arrêts maladie au cours de la période considérée.

L’affection de longue durée (ALD)

Les salariés pris en charge dans le cadre d’une affection longue durée (ALD) bénéficient d’une durée plus longue de versement des d’indemnités journalières : des périodes de 3 à 6 mois renouvelables sur une durée de trois ans maximum. Les indemnités journalières versées pour une ALD ne sont pas soumises à l’impôt sur le revenu. Et les frais médicaux sont pris intégralement en charge par la Sécurité sociale.

Les ALD dites exonérantes (liste de 30 ALD) correspondent à des maladies graves (cancer, mucoviscidose, sclérose en plaques…) ou chroniques (diabète, insuffisance respiratoire, polyarthrite…) prises en charge à 100 % par le régime d’assurance maladie.

Au-delà de 3 ans, le salarié relève jusqu’à sa retraite du régime de la pension d’invalidité si sa capacité de travail est réduite des deux tiers. Le montant de son indemnité est de 30 % du salaire annuel moyen des dix meilleures années en cas d’incapacité partielle et de 50 % en cas d’incapacité totale.

Aux indemnités journalières versées par l’Assurance maladie, s’ajoute parfois un complément de rémunération de la part de l’entreprise à hauteur de 90 à 100 % du salaire brut de référence, incluant les indemnités journalières. Cette compensation s’effectue dans le cadre du régime de prévoyance de l’entreprise ou de la convention collective. Il est important de bien se renseigner sur le régime de prévoyance dont vous relevez car le montant du complément d’indemnité en sera impacté.

Le régime des fonctionnaires

Les fonctionnaires des trois fonctions publiques (d’Etat, territoriale et hospitalière) bénéficient d’un congé maladie ordinaire (CMO), en cas d’arrêt de travail pour maladie. Les trois premiers mois, ils bénéficient du maintien à 100 % de leur traitement indiciaire (primes et indemnités comprises). A partir du 91ème jour, ils perçoivent 50 % de leur traitement. Si le montant de ce demi-traitement est inférieur au montant des indemnités journalières versées par l’Assurance maladie, une indemnité différentielle est versée au fonctionnaire (pour assurer une indemnisation identique à celle d’un salarié du privé). La durée du congé maladie ordinaire est de un an maximum.

En cas de longue maladie, les fonctionnaires (toutes catégories et administrations d’origine) bénéficient du congé de longue maladie (CLM). Ils sont indemnisés pendant 3 ans maximum, à hauteur de 100 % du traitement indiciaire pendant un an, puis de 50 % les deux années suivantes.

Pour certaines maladies (cancer, tuberculose, maladie mentale, poliomyélite ou déficit immunitaire grave et acquis), ce congé peut être prolongé, dès la fin de sa première année, en congé longue durée (CLD). Sa durée est de 5 ans maximum, avec une indemnisation à hauteur de 100 % du traitement indiciaire pendant 3 ans, puis 50 % pour les deux dernières années.

Dépassée cette durée et en cas d’incapacité de travail, les fonctionnaires sont mis en retraite (avec un minimum de 50 % du traitement hors primes), à condition d’avoir 15 ans de service effectif. Dans le cas contraire, c’est le régime général qui verse la pension d’invalidité.

Et la prévoyance individuelle ?

La prévoyance collective (au sein de l’entreprise ou de l’administration) est en cas de longue maladie ou d’invalidité reconnue, une protection financière incontournable. Pour les salariés du secteur privé, la complémentaire santé collective est obligatoire depuis le 1er janvier 2016, avec une prise en charge de la moitié du coût par l’entreprise. Dans les autres cas, vous pouvez, à titre individuel, souscrire un contrat auprès d’un professionnel.

La plupart des contrats garantissent le versement d’indemnités journalières et d’une rente d’invalidité. Le coût d’un contrat de prévoyance varie en fonction du montant et de la durée de l’indemnité versée.

Sachez que la grande majorité des contrats proposés par les mutuelles et les assureurs intègrent le volet « invalidité » comme une garantie complémentaire d’un contrat capital décès, d’autres limitent la durée du versement des indemnités journalières.

Dans tous les cas, il est important d’étudier attentivement les offres que l’on vous propose car les montants que vous percevrez auront un impact sur le niveau et la qualité de votre vie.

    21 commentaires sur “Arrêt pour maladie non professionnelle et longue maladie : l’indemnisation”
    1. Bonjour, je suis en arret maladie longue duree depuis 6 mois, la securite sociale me verse les aj, mais je suis surprise de ne pas voir mon complement de salaire. mon entreprise a une prevoyance qui maintient l’integralite du salaire pdt un an si un an d’ancienneté ce qui est mon cas. 1- Qui dois je contacter pour mon complement de salaire, 2- qui me verse ce complement de salaire? l’employeur , la mutuelle ou la securite sociale? 3- aussi ma fiche de paie ce mois ci est negative de 82€! est ce possible? (salaire 45k€/an).. cest un peu la panique en plus de la maladie.. je vous remercie pour vos precieux elements. So

      1. Bonjour,

        Il convient de vous rapprocher de votre employeur afin de connaître les termes de votre contrat de prévoyance et en savoir plus sur ce point.

        Meilleures salutations
        L’Equipe de Lafinancepourtous.com

    2. Bonjour
      En arrêt de travail depuis novembre 2019. Pour dépression j avais un contrat cdd qui s est terminé le 8 avril est ce que je vais continuer à toucher des indemnités journalière
      Merci

      1. Bonjour,

        Il conviendrait de vous rapprocher de l’Assurance maladie et de votre médecin pour en savoir plus sur ce point.

        Meilleures salutations
        L’Equipe de Lafinancepourtous.com

    3. Bonjour,
      Je reçois des arrêts maladie successifs de 2 mois depuis un an, en fonction d’un cancer toujours sous traitement. Entre temps, j’ai été licenciée (liquidation de la société).
      J’arrive actuellement à l’âge de la retraite; suis-je obligée à la demander ou puis-je continuer à bénéficier de mes arrêts maladie, voire être en congé ALD?
      Merci d’avance pour vos éclairages.

      1. Bonjour,

        Il conviendrait d’interroger l’assurance-maladie sur ce point de la réglementation ainsi que votre médecin.

        Meilleures salutations
        L’équipe de lafinancepourtous.com

    4. Bonjour,

      je suis en arrêt maladie depuis 6 mois ( 3 mois + 3 mois) et mon médecin m’a renouvelé pour 3 mois supplémentaires. J’aimerais savoir si je pourrais demander que je sois reconnu en maladie de langue durée? (pour info je suis reconnu en situation d’handicap avec obligation de soins pendant 2 ans).
      Merci.

      1. Bonjour,

        Seul votre médecin pourrait vous le préciser car des condtions médicales spécifiques existent. Meilleures salutations
        L’équipe de lafinancepourtous.com

    5. bonjour
      je suis en ald depuis 1 an, suite a une rupture d’anévrisme, je suis en rééducation pour plusieurs années.
      le gan me verse un peu plus de 50% de mon salaire, avec la sécurité sociale je ne perd presque rien.
      mon entreprise va être rachetée, est ce que le gan continuera a verser ce complément ?
      merci

      1. Bonjour,

        Sur ce point, il conviendrait de contacter directement cet organisme de prévoyance car si les propriétaires de votre entreprise change d’organisme de prévoyance collectif, cela pourrait avoir une incidence éventuelle. Il faut pouvoir le vérifier dès maintenant.

        Meilleures salutations
        L’Equipe de Lafinancepourtous.com

    6. Bonjour je suis agent territoriale en arret maladie pour reclassemnt professionnelle sachant que tous mes collegues sont en confinement sans travail .Comment je vais être payé pendant le confinement car j’attends un poste.
      Merci de votre réponse, cordialement

      1. Bonjour,

        Nous vous conseillons de prendre contact avec le service des ressources humaines de votre collectivité ou avec votre centre de gestion.

        Meilleures salutations
        L’Equipe de Lafinancepourtous.com

    7. Bonjour, je suis fonctionnaire à la Banque Postale depuis 28 ans. Je travaille avec le virus du si dans depuis 2012. Je suis diabétique type I depuis 2019. Je fais des apnées du sommeil (je dors sous assistancêtres respiratoire depuis 2017). Je suis également traité pour dépression et anxiété. Puis-je prétendre à un congé maladie longue durée? Merci d’avance pour la réponse.

      1. Bonjour,

        C’est votre médecin qui pourrait vous le dire en fonction de votre situation médicale.

        Meilleures salutations
        L’Equipe de Lafinancepourtous.com

    8. Bonjour,

      Je suis arretée pour dépression-Burn out depuis Février 2020 et je crains de passer les 6 mois d’arret. Est ce que l’indemnisation par le prévoyance rentre dans ce cas ?
      Merci de nous aider.

      1. Bonjour,

        Il convient de vous rapprocher de votre mutuelle ou de la prévoyance de votre entreprise pour le savoir. Tout dépend de vos contrats en cours.

        Meilleures salutations
        L’Equipe de Lafinancepourtous.com

    9. bonjour etant en arret pour le confinement du virus car je suis a risque je suis déclaré ald quel sont les indemnités comment vais je être payé merci

    10. Bonjour
      Ayant été licencié en novembre 2017 ,la portabilité de mon contrat prévoyance s’arrete au 1.12.2018 .Depuis avril 2018 (toujours demandeur d’emplois) j’ai eu un tres grave accident et je suis en longue durée maladie ..Jusqu’a présent mon contrat de prévoyance me versé mes indemnités en complément de la sécurité social Mais apres la fin de portabilité est ce que cela va continuer , sachant que j’ai eu cet accident pendant la portabilité
      Cordialement .

      1. Bonjour,

        A priori, si vous n’êtes plus couvert par votre mutuelle vous ne pourrez plus bénéficier des indemnités qui vous étaient jusque-là versées. N’hésitez pas à contacter votre mutuelle pour en savoir plus.

        Meilleures salutations
        L’Equipe de Lafinancepourtous.com

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